آغاز بنای مسجد النبی را به دوره صفويه نسبت می‌دهند، اما چنين به نظر می‌رسد كه پس از انقراض صفويه در اثرعدم توجه به صورت ويرانه‌ای درآمده و در دوره قاجاريه از نو بازسازی شده است. حياط مسجد به شكل مستطيل و درازاي آن از شمال به جنوب است. هر يک از جهات چهار گانه مسجد،‌ ايوانی بلند در وسط دارد و دو گوشواره و سپس دو شبستان يا رواق در دو سوی آن بنا شده است. در دو بخش خاوری و باختری بنا، شبستان‌ها باريک‌تر و در بخش‌های شمالی و جنوبی، پهن‌تر و بزرگ‌ترهستند. رواق‌ها يا شبستان‌های شمالی و جنوبی، هر يک دارای چهار طاق نما‌ و رواق‌های خاوری وباختری دارای نه طاق نما هستند. هر يک از طاق نماها دارای ارسی سه چشمه‌ای بوده است كه امروزه بيش‌تر آن‌ها فرسوده شده‌اند و به جای آن‌ها در چوبی كار گذاشته‌اند. در وسط حياط مسجد يک حوض بسيار بزرگ سنگی به شكل مربع مستطيل ساخته شده است كه برای وضو گرفتن از آن استفاده می‌شود.