آب و هوای مراغه نسبتا سرد و نيمه خشك است.براساس تقسيم بندی كوپن، اين شهرستان دارای سه اقليم مديترانه ای گرم، مديترانه ای استپی، معتدل و كوهستانی سرد است. آب و هوای شهر مراغه مركز شهرستان نيز نسبتا سرد و نيمه خشك بوده و بيش ترين درجه حرارت در تابستان ها 36 درجه بالای صفر و کم ترين آن در زمستان 21 درجه زير صفر است. ميزان باران ساليانه مراغه به طور متوسط در حدود 370 ميلی متر می باشد.