يكی ديگر از مساجد تاريخی مراغه، مسجدی موسوم به شيخ بابا است كه آن نيز در سال های اخير بازسازی شده است. اما از بنای اصلی و اوليه مسجد آثاری به جای مانده كه در جريان نوسازی مورد استفاده قرار گرفت و هر كدام از آن ها ويژگی به خصوصی از نظر معماری و قدمت تاريخی دارند. اين مسجد در قسمت شمالی خيابان خواجه نصير واقع شده است.