هواي اين شهرستان معتدل متمايل به سرد و نيمه مرطوب است. هواي قوچان مركز شهرستان نيز معتدل و نيمه مرطوب بوده و بيش‌ترين درجه حرارت درتابستان‌ها 35 درجه بالاي صفر و كم‌ترين آن در زمستان‌ها 10 درجه زير صفر است . ميزان باران ساليانه قوچان به‌طور متوسط به حدود 410 ميلي‌متر مي‌رسد.